综合医疗保险和住院医疗保险
住院医疗和综合医疗的区别之一：适用人群
虽然住院医疗和综合医疗都属于基本医疗保险，但二者的适用人群是不一样的。住院医疗则主要适用于非本市户籍人员，包括失业、低保对象、特殊困难的非本市城镇在职人员、非本市户籍的农村人员，以及当地市政府规定的其他人员；而综合医疗保险主要适用于本市户籍居民，包括：具有本市户籍的在职人员和原农村城市化人员、具有本市户籍但已经退休的人员、在本市办理就业登记的外籍人员以及当地政府规定的其他人员。当然，随着医疗体质改革，住院医疗和综合医疗的区别在适用人群方面开始变得不再明显。
住院医疗和综合医疗的区别之二：保障范围
由于住院医疗参保人没有个人账户，而综合医疗参保人则拥有自己的独立账户，所以住院医疗和综合医疗的区别还表现在保险的保障范围上，具体来说：参加住院医疗保险的人主要享受住院时的费用报销或补偿，可以享受少量的指定的门诊报销，无法享受药店买药的报销，也无法享受生育险；而参加综合医疗保险的参保人则可以享受住院、药店买药、看门诊，以及大病门诊报销和生育保险。
住院医疗和综合医疗的区别之三：缴费比例
住院医疗和综合医疗的区别还体现在二者的缴费比例上，总体来说，综合医疗缴费要比住院医疗高。以深圳市为例，深圳市住院医疗保险的缴费比例是0.9%，单位承担0.7%，参保人承担0.2%；而综合医疗保险的缴费比例相比住院医疗保险就要高得多，其费率为工资的7%，单位承担5%，参保人承担2%。
最后，值得一提的是，住院医疗和综合医疗的区别将会越来越小，比如适用人群已经逐渐模糊化，而保障范围也将逐渐统一，以体现医疗改革的人性化，至于缴费比例的差别应该会成为二者未来最大的区别。